当纳税人是善意对方的增值税专用发票虚开时，根据《中华人民共和国国家税务总局增值税专用发票纳税人善意收购虚开》卖方使用的专用发票发票其所在省份，以及卖方名称、印章、货物数量的全部内容并且没有证据证明买方知道卖方提供的特供发票是通过非法手段取得的，没有对买方偷税漏税,纳税人善意取得虚开的增值税专用款，能够从卖方发票重新取得防伪税控系统开具的合法有效的增值税专用款。
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1、 善意取得 虚开增值税专用 发票如何处理纳税人善意取得虚开的增值税专用款，能够从卖方发票重新取得防伪税控系统开具的合法有效的增值税专用款。或已取得合法有效的手册使用发票并取得销售方所在地税务机关或依法正在查处销售方行为的证明虚开特殊使用发票的，允许抵扣进项税款或出口退税；不能重新取得合法有效的专用发票的，不得抵扣进项税款或者不予出口退税，依法追缴买方抵扣的进项税款或者取得的出口退税。扩展信息:对于善意的获取有定义的标准。需要同时满足以下四个条件:买卖双方存在真实交易；卖家使用其所在省份的专用发票；专用发票中注明的卖方名称、印章、货物数量、金额、税额与实际情况相符；没有证据证明买方知道卖方提供的专用发票是通过非法手段取得的。只有满足以上条件，买方才不会因偷税漏税或骗取出口退税而受到处罚。
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2、增值税 虚开但交税了纳税人受理虚开增值税专用发票，应根据不同情况办理。当纳税人是善意对方的增值税专用发票虚开时，根据《中华人民共和国国家税务总局增值税专用发票纳税人善意收购虚开》卖方使用的专用发票发票其所在省份，以及卖方名称、印章、货物数量的全部内容 并且没有证据证明买方知道卖方提供的特供发票是通过非法手段取得的，没有对买方偷税漏税。 但根据有关规定，不得抵扣进项税款或不予出口退税；对买方抵扣的进项税款或取得的出口退税依法追缴。买方可从卖方发票重新取得防伪税控系统出具的合法有效的独占使用，或通过手发票重新取得卖方虚开 3所在地税务机关出具的合法有效的独占使用。
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