合法有效增值税普通发票制造商可接受,因此，一般纳税人货运代理行业在取得增值税Transport发票后，可以按照认证后取得的增值税发票面扣除率进行扣除,是的，免税项目不能开具增值税专用发票，只能开具增值税普通发票,所以外贸公司收货代发增值税专用发票，如果出口货物不是免税货物，外贸公司可以抵扣。
根据中华人民共和国增值税暂行条例第十条规定，免税项目的进项税额不得从销项税额中扣除。因此，对于出口货物的内陆运输费用和经营费用的抵扣，需要分析出口货物是应退税还是免税，即出口免税货物相关费用的进项税额不得抵扣。当然，属于出口单价的境外运输费、保险费、佣金不在抵扣范围内，要冲减当期出口收入。另外，由于国际货代企业属于服务业，根据国家税务总局关于增值税一般纳税人支付的货代费不得抵扣进项税额的批复(国54号)，已取得国际货代业发票的不得作为运输费用抵扣。但是承诺的是“营改增”试点单位的增值税special发票，而且是国内环节的费用，所以劳务对应的货物可以抵扣进项税。所以外贸公司收货代发增值税专用发票，如果出口货物不是免税货物，外贸公司可以抵扣。
根据《关于开展我国交通运输业和部分现代服务业营业税改征增值税试点的通知》增值税试点税收政策(财税37号)第一条规定，经国务院批准，自2013年8月1日起，在全国范围内开展交通运输业和部分现代服务业营业税改征增值税试点。第十二条和第十三条规定，实施营改增后提供运输劳务增值税的税率，一般纳税人为11%，小规模纳税人为3%。因此，一般纳税人货运代理行业在取得增值税Transport发票后，可以按照认证后取得的增值税 发票面扣除率进行扣除。但铁路运输未纳入营改增试点，仍按照运输费用结算凭证上注明的运输费用金额和7%的扣除率计算进项税额。
是的，免税项目不能开具增值税专用发票，只能开具增值税普通发票。根据中华人民共和国国家税务总局公告(2014年第42号)，试点纳税人可以通过其他代理人为委托人间接办理国际货物运输、从事国际运输的运输工具进出境、安排引航、靠泊、装卸等与货运代理相关的业务手续。 其中可按照《财政部中华人民共和国国家税务总局关于将铁路运输和邮政业纳入营业税改征范围的通知增值税 Pilot》附件3第1项。 因此，上述情况属于一般纳税人货代且企业提供国际货代服务的，可按上述规定享受免税政策，免税项目可不开具增值税专用发票，只开具/。合法有效增值税普通发票制造商可接受。
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